Il programma extract esegue l'estrazione degli scans. Questo accetta in ingresso un file (.lis) fornito dell'utente, che contiene l'elenco degli scans che si vogliono estrarre dall'archivio, specificando un numero di scan per riga. La procedura usa l'indice toolindex.dat per localizzare il file da cui estrarre lo scan richiesto. Lo scan viene quindi scritto in un file temporaneo in formato TOOLBOX.